La Iglesia de Nuestra Señora de las Mercedes, conocida popularmente como “La Merced”, fue construida inicialmente de madera tosca y techo de paja, entre los años 1534 y 1539. Su estilo barroco, realmente elaborado, la hacen destacarse como una de las principales manifestaciones arquitectónicas de la época colonial. Este templo fue saqueado por los piratas comandados por John Davis, natural de Jamaica, que incursinó desde el río San Juan hasta Granada un 29 de junio de 1665. En 1854 fue destruída parcialmente durante la guerra civil entre ligitimistas y conservadores, posteriormente fue saqueada en 1856 por filibusteros al mando de William Walker. Fue restaurada en 1862 por Esteban Sandino.
Su fachada consta de dos calles, cada una con su propia puerta. La torre, de tres cuerpos, sirve de campanario, reloj y es el mirador favorito de los visitantes ya que desde ahí, se observa toda la ciudad.
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